مسیر پنتوز فسفات (شنت منوهگزومونوفسفات): این مسیر تماما در سیتوزول انجام گرفته و هدف اصلی آن تامین NADPH و ریبوز مورد نیاز برای بیوسنتز اسیدهای نوکلئیک می باشد از 2 فاز اکسیداتیو و غیر اکسیداتیو تشکیل شده است و اهداف اصلی این فرایند در فاز اکسیداتیو حاصل می گردد. ورودی این مسیر 3 مولکول گلوکز می باشد و خروجی آن 2 مولکول فروکتوز 6- فسفات و 1 مولکول گلیسرآلدهید 3- فسفات، 3 مولکول CO2 و 6 مولکول NADPH2 می باشد. NADPH2 به عنوان یکی از مواد مورد نیاز در اکثر واکنشهای آنابولیسمی و نیز واکنش های سم زدایی که در کبد انجام می شود و همچنین واکنش تجزیه آب اکسیژنه (H2O2) در گلبول قرمز مطرح می باشد و هر گونه اختلال در تولید آن به اختلال در این واکنشها منجر می شود در بدن 3 منبع برای تولید NADPH2 وجود دارد که مهمترین آن مسیر پنتوز فسفات می باشد آنزیم اصلی این مسیر گلوکز 6- فسفات دهیدروژناز (G6PD) می باشد و هرگونه اختلال در فعالیت گلوکز 6- فسفات دهیدروژناز به اختلال در تولید NADPH2 ختم شده و لذا واکنشهای آنابولیسمی و سم زدایی با مشکل مواجه می شود بیماری فاویسم که یک بیماری ژنتیکی است و در شمال ایران زیاد است ناشی از عملکرد ناقص G6PD می باشد این افراد در صورتی که در معرض نفتالین، DDT، پریماکینون (که برای درمان مالاریا استفاده می شود) و یا مصرف گیاه باقلا قرار گیرند علائمی مثل تنگی نفس، کبودی پوست، سردرد، سرگیجه، بروز یرقان و از کارافتادن کلیه ها در درازمدت را از خود نشان می دهند.

مسیر پنتوز فسفات ATP نمی سازد بلکه 2 عمل اصلی دیگر را که تولید NADPH برای سنتزهای احیایی مانند ساخت اسیدهای چرب و استروئیدها است و تهیه ریبوز برای ساخت نوکلئوتیدها و اسیدهای نوکلئیک را انجام می دهد.